Наша ДНК содержит информацию о всех возможных структурах, которые можно построить в нашем организме. Разные участки ДНК копируются и используются как чертёж для построения разных белков. Допустим, ваш организм может быть и рад выдать вам голубые глаза, но у него просто нет инструкции для белков голубой радужки, он без понятия, как их делать. А для зелёных инструкция есть, вот глаза и зелёные.
Любопытно, однако, что иногда какая-то "инструкция" у нас в генах есть, но почему-то белки по ней не строятся. Это может быть и хорошо, и плохо. Допустим, у вас может быть ген какой-то аллергии, которая проявляется или наоборот пропадает лишь во взрослом возрасте. Или ген-защитник от рака, который неожиданно перестаёт работать. Способы этого "выключения" могут быть разные, но один из них – это метилирование ДНК. В этом случае к участку ДНК прицепляется молекула, которая блокирует к ней доступ. То есть молекула-копировальщик подходит, чтобы участок скопировать и построить белок, а ей просто не за что зацепиться – "крючок" уже занят! И всё, ген больше не работает.
Наши гены одинаковые во всех клетках нашего организма и неизменны в течение всей нашей жизни. А вот их метилирование, это "вкл-выкл" – нет. Окружающая среда, стресс, медикаменты, возраст – всё это может влиять на то, какие гены сейчас работают, а какие нет. Конечно, хотелось бы досконально понимать, как именно и на какие конкретно гены. Инструмент, о котором мы написали статью – это небольшой помощник в таком анализе.
Когда аппаратура определяет, где на генах есть "блок доступа", а где нет, она может совершить ошибку и что-то не измерить. То есть у вас будет даже не 0, а просто пустая клетка. А вам для последующего анализа это не подходит, вам нужно, чтобы в каждой клеточке что-то было. Просто от фонаря число ставить тоже как-то нехорошо – вдруг это повлияет на ваши выводы. Мои соавторы несколько лет назад придумали метод, который находит числа, близкие к настоящим, и подставляет их. А теперь мы с ними этот метод сильно ускорили! В одном случае стало работать 30 минут вместо 3-х дней, в другом – 20 минут вместо суток. При этом наши идеи ускорения довольно общие, так что могут быть полезны даже тем, кто работает с другим типом данных.
Старалась объяснить понятно, но тема непростая. Если есть вопросы – пишите в комментариях 👍