Если Вас уведомили в устной форме или рассылкой по электронной почте, то вы можете смело отправлять такое в мусорку. Только на офиц. Приказ можно писать ответное заявление. В соответствии со ст.5 ФЗ № 157 и подтверждающим ее приказом №229 человек может в письменном виде отказаться от прививок.
Отказ от мед. вмешательства по введению лек. препаратов оформляется и заверяется мед. раб. мед. организации по спец. форме, и после оформления включается мед. раб. в мед. документацию пациента (п. 12 Перечня, утв. приказом Минздрава РФ от 23.04.2012 N 390н; п. 9, 10 Порядка дачи инф. добр. согласия и отказа от него, утв. приказом Минздрава РФ от 20.12.2012 N 1177н). Поэтому, юридически корректно отказаться от вакцинации можно только в присутствии мед. работника, имеющего бланк отказа (такие бланки, скорее всего, есть в мед. организациях, а не в пунктах вакцинации). После оформления отказа - получить в мед. организации заверенную копию такого документа, снять с неё копию и приложить к письменному заявлению работодателю.