Зачем биоинформатику «мокрая» биология?
Рассказывает руководитель Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ Павел Ямщиков:
Уже на этапе планирования эксперимента биоинформатик может предложить экспериментальные решения (например, дополнительные контроли или сбор дополнительной информации для метаданных) для того, чтобы потом было проще и надёжнее анализировать данные. Кроме того, понимание лабораторных этапов и знание сильных и слабых сторон «мокрых» методик помогает корректно интерпретировать результаты: видеть, как протокол подготовки библиотеки влияет на результаты секвенирования и отличать настоящую биологическую вариабельность от экспериментальных ошибок.
Лабораторная практика – один из лучших способов разобраться в тонкостях экспериментальной части. В рамках Магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" такая возможность доступна студентам на первом курсе обучения. Так, студенты проходят практику по различным вариантам NGS, включая секвенирование единичных клеток и пространственную транскриптомику, на базе лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ (Томск) или лаборатории биологии единичных клеток НИИ молекулярной и клеточной медицины Медицинского института РУДН (Москва).
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/
Рассказывает руководитель Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ Павел Ямщиков:
Не обязательно (и чаще всего невозможно) быть экспертом одновременно и в «мокрой», и в «сухой» биологии. Зато для эффективного сотрудничества и корректного анализа данных биоинформатику полезно разбираться в том, как работают «мокрые» биологи.
Уже на этапе планирования эксперимента биоинформатик может предложить экспериментальные решения (например, дополнительные контроли или сбор дополнительной информации для метаданных) для того, чтобы потом было проще и надёжнее анализировать данные. Кроме того, понимание лабораторных этапов и знание сильных и слабых сторон «мокрых» методик помогает корректно интерпретировать результаты: видеть, как протокол подготовки библиотеки влияет на результаты секвенирования и отличать настоящую биологическую вариабельность от экспериментальных ошибок.
Лабораторная практика – один из лучших способов разобраться в тонкостях экспериментальной части. В рамках Магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" такая возможность доступна студентам на первом курсе обучения. Так, студенты проходят практику по различным вариантам NGS, включая секвенирование единичных клеток и пространственную транскриптомику, на базе лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ (Томск) или лаборатории биологии единичных клеток НИИ молекулярной и клеточной медицины Медицинского института РУДН (Москва).
Подробнее о программе магистратуры: https://master-omics.ru/