Postlar filtri


Милейший подарок 👽

С Новым годом, товарисчи!


Science in telegram dan repost
Video oldindan ko‘rish uchun mavjud emas
Telegram'da ko‘rish


Красные пики dan repost
Есть такая интересная теория размножения РНК, которая рассматривает среду просто как способ копирования информации. Например, по этой теории как медведь, так и его берлога — равноценные части среды для этих самых РНК, и принципиальных различий между этими двумя компонентами нет. ДНК медведя — способ сохранения и приумножения РНК, а весь остальной медведь — среда для того, чтобы его ДНК нормально работали. Берлога — чтобы медведь нормально работал. Границы между берлогой и медведем нет, они просто инструменты для РНК.

Ну это как если вы будете рассматривать бобра как способ копирования бактерий, переваривающих целлюлозу: он для них просто зубастая пушистая оболочка.

Один из самых лютых примеров в этом плане — ихновирусы, они же полидисперсные ДНК-содержащие вирусы. В общем, есть такие ихневмониды, осы-наездники, которые охотятся на гусениц, превращают их в среду для роста, откладывают в них личинку, и дальше эта личинка ест гусеницу. Недавно раз я видел аккурат такого в янтаре, так что они занимаются этим бизнесом уже несколько миллионов лет. Принцип примерно как у чуженёнка из фильма «Чужой», только без особых спецэффектов. Трансформация гусеницы в живое детское питание происходит с помощью ихновируса, который делает инъекцию кода в клетки гусеницы и дальше отвечает за преобразование процессов внутри неё. Всё по красоте, оса впрыскивает вирус вместе с личинкой, и он действует-злодействует.

Проблема в том, что там вместо целого вируса с конструктором капсида и всем остальным передаются только какие-то изолированные куски кода, которые работают эффекторами для гусеницы. Основного кода вируса там нет. В смысле, было бы логично, если бы вирус передавался целиком, а не только «патронами»-эффекторами. Иначе как он воспроизводится дальше?

Оказывается, основной код вируса уже есть в осе. Её родной геном полностью включает код полиднавируса (да, его именно так перевели надмозги). Вирус активируется только в женских особях при размножении и делает те самые эффекторы для гусеницы, а так живёт себе в виде информации внутри кода осы, причём не в одном месте, а в виде нескольких «библиотечных функций» в рассеянном виде. Оса обращается по ссылкам к своему собственному геному, собирает и запускает код вируса из себя, когда нужно, даёт ему произвести эффекторы. А потом снова просто хранит, когда надобность отпадает.

Кажется, они оба — и вирус, и оса — этому рады. Ну, в смысле, им норм.

В гусеницу в итоге встраиваются гены осы, которые её обрабатывают. В осе есть код перехвата управления гусеницей, доставшийся от полиднавируса. Она собирает фрагменты физической копии полиднавируса для доставки кода в клетки гусеницы, дальше её осиные гены (позаимствованные у вируса) становятся генами гусеницы. Потому что ген, знаете ли, не принадлежит какому-то организму, он просто информация, а информация должна быть свободной.

Кстати, термин «мем» впервые был применён для единицы именно генетической информации у Докинза в «Эгоистичном гене». И в целом можно рассматривать весь мир как среду для репликации информации. А РНК — как способ чтения мемов.

246 0 16 6 13

Авва dan repost
Мне всегда было интересно, как можно научиться двигать какими-то частями тела, если не знаешь, что для этого делать? Ну вот я не умею двигать ушами; как можно меня научить, если нет субъективного ощущения "отдать команду ушам", как есть "отдать команду руке", или носу, или пальцу ноги?

(в последнее время меня это еще больше стало интересовать с практической точки зрения ввиду диспраксии ребенка А. и его проблемы планировать/выполнять движения мышц, управляющих губами, языком, челюстью... Например: как научить ребенка выпячивать губы для "у", если он не понимает, как это сделать, и не может даже начать повторять движение? Одна из возможностей - помогать ему физически делать это движение, обращать внимание на то, как это "ощущается", и поощрять любое пусть даже крохотное собственное "вкладывание" в результат. Но это так, в скобках...)

На днях наткнулся на интересную статью в этом духе: "Training of voluntary torsion". Глаз умеет вращаться вокруг оси "вперед-назад" (торсионное вращение). Обычно это вращение является частью движения глаза для фиксации на определенной цели, и подчиняется так называемому "закону Листинга". Количество вращения невелико, несколько градусов, и не является осознанным. Если вы наклоните голову влево или вправо, сохраняя фиксацию взгляда на какой-то цели, ваши глаза будут вращаться в обратном направлении, чтобы нейтрализовать вращение головы; это может быть большое вращение, скажем 20 градусов, но тоже не под сознательным контролем. В статье 1978 года описывается процесс тренировки сознательного торсионного вращения глаза, при зафиксированной голове. Интенсивные тренировки позволяют достичь размаха в 20-30 градусов за 25-35 часов, способность развивается плавно - примерно 0.8 градуса за час тренировки. Субъективно при это возникает ощущение (ложное), будто все тело поворачивается в ту же сторону, что и глаз, а мир вокруг наоборот крутится в другую. Я не знаю, есть ли у этого какие-то практические применения; теоретически это дает важную информацию о том, как мозг управляет движением глаз.

Задумался над этим и поискал заодно и про уши. Нашел крышесносную статью 2019 года ("Development of a training paradigm for voluntary control of the peri-auricular muscles: a feasibility study.") о том, как добровольцев учили двигать ушами с помощью компьютерных игр, где даже малейший импульс активности в соответствующих мышцах - считываемый датчиками - помогал сделать нужное в игре действие. Идея в том, чтобы дать еще один канал коммуникации для людей с полным параличем (кроме моргания, которое не всегда работает, если я верно понимаю). Из 13 участников 10 научились в той или иной мере двигать ушами (от 1 до 5 миллиметров).


Накидывайте ваши варианты подобных #memes подарков в каменты




Pan Meditat dan repost
Глазастые хвосты, инструкции для сборки двухголовых червей и клеточная карта тела

Познакомился с работой биолога Майкла Левина. Изучает он вопросы биологии развития (developmental biology) – то есть, как строится организм. И оказывается, что примерно десятилетие назад Левин начал переворачивать укоренившиеся представления о том, как вообще мы превращаемся из пары клетов в, собственно, нас самих.

Популярное и уже закрепленное в виде аксиомы понимание развития тела ставит в центр картины жизни гены. Вот как Докинз опубликовал бестселлер «Эгоистичный ген», так и закрепилось, превратилось в общее знание. Сама по себе биология таким фундаментом не ограничивается, но для большинства ответ на тайны жизни, пожалуй, если не кроется в генах, то хотя бы вращается на их орбите. Но все же для перехода от зародышей, семян и яиц к детям, деревьям и зверям нужно намного больше тонкой работы, чем просто наличие инструкций. Что еще нужно и почему руки у нас растут (обычно) из правильного места – это как раз вопросы онтогенеза, которыми Левин и занимается.

В сущности, Левин сравнивает гены с кодом ассемблера – необходимым слоем для работы софта, обращающимся к железу напрямую; но программисты сегодня вообще нечасто работают на таком уровне. Для клеток, чтобы они развивались в нужном качестве и вставали на свои места, тоже должен быть свой уровень организации. И здесь Левин вытаскивает хорошо забытое старое под названием «биоэлектрическая сеть».

Можно сказать, теория Левина даже несколько упрощает понимание морфогенеза, приравнивая в принципе любые клетки к нейронам. Биоэлектрическая теория предполагает, что вообще все клетки организма обмениваются электрическими импульсами, ровно как это делают и нейроны – все необходимые инструменты у них для этого есть, просто происходит этот процесс намного медленнее. А различить эту форму коммуникации команде Левина помог плоский червь планарий.

Планарий прекрасен: не стареет, восстанавливается из любого отрезанного куска, но при этом не подвержен раковым заболеваниям и вообще каким-либо дефектам. Порежь его на десяток кусков – получишь десяток особей. Причем регенерирует планарий исправно, из головы вырастает хвост, из хвоста вырастает голова. Как организм определяет, что нужно отрастить, но никогда не отращивает ничего лишнего?

В ходе исследований пришли к выводу, что справляются клетки планария с помощью “потенциалов мембран” – стабильного электрического состояния, позволяющего сориентировать себя относительно остальных клеток тела. Именно эта информация и помогает клеткам построить голову в нужном месте. И как только раненых планариев поместили в раствор, блокирующий определенные ионные каналы – следовательно, искажающий и информацию, передаваемую между клетками – они начали отращивать по две головы или вовсе головы, анатомически соответствующие другим видам. И никакого вмешательства в гены!

За планариями последовали лягушки, которым уже успели отрастить дополнительные лапы и функционирующие глаза на хвостах. Характерно, что даже если немного перемешать “лицо” головастиков на определенной стадии развития (в исследовании их элегантно обзывают “пикассоподобными”), то в процессе развития организма все равно все части встанут на свое место.

Работа Левина интересна, в общем, не только тем, что генетический взгляд на развитие организма дополняется биоэлектрикой, но и значительным усложнением нашего понимания “интеллекта” в самом широком смысле (здесь как будто бы должны обрадоваться панпсихисты). В то же время, коллеги в целом относятся ко многим его выводам скептически, не в последнюю очередь из-за перехода вообще на другой уровень абстракций в рассуждениях, хотя никто не опровергает его эмпирические исследования. Возможно, из работы Левина получится извлечь какие-то практические выгоды, а может быть, он пройдет путь Дарвина. Надо следить.


Научно-Технический·LAB-66·Лабораторный журнал беларуского химика dan repost
Угроза из Зазеркалья

прим. мое: честно признаюсь, пишу этот пост и не верю в реальность написанного. Как будто снится сон. В sci-fi я похожего сюжета точно не встречал.

Помните в августе я рассказывал про живую легенду, мой детский эталон для подражания, про Крейга Вентера 💔 и его Synthia? Не прошло и полугода, как мой глаз зацепился за эту фамилию в новостях. Я сразу же пошел смотреть что там. Вентер - это абсолютно не тот человек, который будет интересоваться чем-то банальным, предсказуемым и общеизвестный. Вентер - это человек который жил, живет и надеюсь еще долго будет жить на научном фронтире. Я (к сожалению) не ошибся в своих ожиданиях...

***
Имя Крейга Вентера всплыло в связи с открытым обращением группы из 38 ученых, среди которых есть эволюционщики, синтбиологи, иммунологи, биобезопасники, и микробные экологи. Обращение это опирается на 300-страничный отчет, подготовленный упомянутыми экспертами. Я решил написать про него, потому что ситуация здесь 1:1 напоминает мне ситуацию, которая сложилась с т.н. искусственным интеллектом и законами Асиломара. Но дело осложняется тем, что теперь речь идет не о компьютерах, речь об угрозе со стороны "зеркальной жизни", возможности которой даже мне со всей моей фантазией представить сложно.

***
В химии есть такое понятие как "хиральность" - интересное свойство, которое есть у молекул с углеродом. Одна и та же молекула при внешнем сходстве могут отличаться как правая и левая рука, быть зеркальными отражениями (т.н. энантиомерами). Чаще всего это понятие встречается в фармацевтике, так как молекулы одного химического состава, но разной хиральности (т.н. (S) лево- и (R) правовращающие) обладают принципиально разной активностью. Пару примеров. Неотличимые химически: (R)-талидомид - безопасный седатив, а (S)-талидомид вызывает тяжёлые врождённые дефекты у младенцев; (R)-лимонен - пахнет апельсином, а (S)-лимонен - лимоном; (S)-метамфетамин - мощный наркотик и психостимулятор, а (R)-метамфетамин — противоотёчное в назальных спреях.

Вся известная нам биологическая жизнь построена на молекулах одной и той же хиральности. Молекулы ДНК и РНК состоят из "правых" нуклеотидов, а все белки - из "левых" аминокислот. Но появись исследователи, которые вместо поиска решений каких-то существующих проблем решили создавать (микро)организмы с использованием изомеров молекул, отзеркаленных с молекул, которые используются в биологических организмах Земли. Зачем им это? Они и сами не знают. И именно эта странная упоротость слепота некоторых ученых игнорирующих этику и заставила четыре десятка лучших на планете экспертов собраться и написать открытое письмо с просьбой о прекращении подобных исследований и/или введения моратория на финансирование таких проектов. Я думаю объяснять не нужно, как к таким призывам относится Китай или какой-нибудь Иран

Бьющие тревогу ученые говорят о том, что отзеркаленные микроорганизмы (энантиномер-синтбио) могут стать причиной новых, абсолютно непредсказуемых инфекций. Для людей, животных, растений. На создание первого синтетического "зеркального" микроорганизма уйдет, возможно, около 10 лет. Но в том, что он будет сделан сомнений ни у кого не возникает. Такие "инфекции из Зазеркалья" нельзя будет сдержать, просто потому что не будет существовать никаких естественных способов их сдерживания. Ни антибиотиков, ни бактериофагов, ни даже генов с информацией об этом. Н-и-ч-е-г-о. Абсолютная чужеродность.

Предположу, что простые организмы, вроде "энантиомерных" водорослей, мхов, лишайников, даже растений тоже смогут достаточно быстро адаптироваться к нашему миру. И будут, скорее всего абсолютно токсичны для всех, кто рискнет их употребить. Как "антиматерия", только биологическая. А еще такие организмы (скорее всего) смогут неплохо конкурировать с организмами нашего мира и, при полном отсутствии естественных врагов, достаточно быстро станут доминирующими видами, уничтожив все привычное нам. Вместе с нами самими.

Сценаристы и фантасты вас пугали пришельцами? Так вот и они ☝️

293 0 18 11 15



Ряды Фурье dan repost
Взяли эмбрионы макака, добавили туда человеческих плюрипотентных стволовых клеток и получили химеру с человеческими тканями.

Для чего всё это нужно? Ну, чтобы выращивать прямо наши ткани и органы в ком-то, кого можно на эти органы смело пустить. Выделили клеток, подсадили в эмбрион, дальше в семье появился макак Вася, которого 5 лет все любят, а потом он новая печень для папы.

Если сильно упрощать, можно взять фреймворк макака, подключить конструкторы объектов и классы от человека, и это мало того, что более-менее нормально смержится, так ещё и управляющий код макаки корректно соберёт человеческие ткани. В смысле, утрируя, прям макак может покрыться, например, человеческой кожей.

Раньше так пробовали с мышкой и свинкой. Но с ними проблема: фреймворк млекопитающего разошёлся на грызунов, копытных и приматов и всё это развивалось независимыми командами 90 миллионов лет. Поэтому есть некоторые различия, и они слишком серьёзные, чтобы заработало.

Понятное дело, до органов для бати пока сильно далеко, пока это фундаментальные исследования, а не прикладные.

Но если вдруг вы макак, прямо сейчас стоит серьёзно напрячься.

Что конкретно сделали:
— Ввели человеческие расширенные плюрипотентные стволовые клетки (hEPSCs) в бластоцисты обезьян на 6 день после оплодотворения. Расширенные — это те, которые лучше дифференцируются в сравнении с обычными эмбриональными стволовыми клетками или индуцированными плюрипотентными стволовыми клетками
— Эмбрионы культивировали ex vivo до 19-20 дня развития.
— Человеческие клетки выжили внутри эмбриона. Размножались там. Превратились в различные типы клеток, которые обычно формируют эмбрион (эпибласт, гипобласт) и некоторые внезародышевые ткани. Но они редко превращались в клетки трофэктодермы (формирует плаценту).

Дальше уже развивать организм по этике нельзя, поэтому продолжения пока нет.

Благодаря этому учёные получили принципиальный ОК на будущие такие исследования, немного отреверсили, что так и как в эмбрионах и знатно задолбали этическую комиссию.

Работа вот.
Вот ещё рядом работа про то, как аналогичные опыты проводили на мозговых клетках, возможно, чтобы как-нибудь потом получить глупый мыш Элджернон.

Главное, не спрашивайте, не спас ли кто из лаборантов милую маленькую обезьянку домой.




Denis Sexy IT 🤖 dan repost
Мне в личку написало пару человек, что этот отчет фейк и написан по политическим мотивам, я не согласен на такую риторику:

– Если мы будем избегать официальных исследований и государственных отчетов США на тему, которая даже их подставляет, то мы не лучше конспирологов – верим в то что хотим, игнорируя новые вводные с доказательной базой, я честно не хотел бы быть таким человеком, хоть и мне не хочется верить во многие вещи (включая, в эту или в помилование преступлений своих близких если ты президент, но я меняю картину мира на основе новых знаний, считаю это нормальным)

– Поскольку, деньги налогоплательщиков США, косвенно шли на самую тяжелую эпидемию за последние 100 лет, этот отчет изучат до символа, и если там будет много ошибок - их найдут, я сошлюсь на контр-исследование с хорошей репутацией, и мы сможем почитать его

– В США нет монолита мнений, это страна с многими противоборствующими силами, проверкой фактов займутся все известные репортеры-ученые-медиа, поэтому долго ждать не придется

– В изучение отчета заинтересованны все страны пострадавшие от ковида

Факт остается фактом: отчет с доказательной базой про лабу – уже есть


Denis Sexy IT 🤖 dan repost
⚡️ Коронавирус вероятнее всего был выращен в лаборатории

Подкомитет по короновирусной пандемии США выпустил отчет на 520 страниц, про:

1. Исследовательскую деятельность Уханьского института вирусологии (WIV):

Согласно данным, сотрудники WIV проводили исследования, связанные с усилением функций вирусов, включая генетические модификации коронавирусов. Отчёт ODNI от июня 2023 года указывает, что WIV сотрудничал с учёными, связанными с Народно-освободительной армией Китая, в области исследований, связанных с общественным здоровьем, а также в проектах по биобезопасности и биозащите.

2. Нарушения биобезопасности в WIV:
В отчёте ODNI от июня 2023 года отмечается, что некоторые исследователи WIV могли не соблюдать надлежащие меры биобезопасности до начала пандемии, что увеличивало риск случайного заражения.

3. Заболевания сотрудников WIV осенью 2019 года:
Госдепартамент США в январе 2021 года сообщил, что несколько исследователей WIV заболели осенью 2019 года симптомами, схожими с COVID-19 и обычными сезонными заболеваниями, до первых официально зарегистрированных случаев инфекции.

Самая вишенка отчета:

США косвенно финансировали исследования в Уханьском институте вирусологии (WIV) через гранты, предоставленные Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), частью Национальных институтов здоровья (NIH), организации EcoHealth Alliance. Эти гранты поддерживали исследования коронавирусов у летучих мышей, включая сбор образцов и анализ их потенциала передачи человеку.

Однако, в 2021 году NIH признал, что некоторые из этих исследований включали эксперименты, которые могли быть классифицированы как “усиление функции” (gain-of-function), что вызвало споры и привело к усилению надзора за такими исследованиями. В мае 2024 года Министерство здравоохранения и социальных служб США (HHS) приостановило и затем прекратило федеральное финансирование EcoHealth Alliance, ссылаясь на недостаточный мониторинг исследований и несообщение о высокорисковых экспериментах.

Таким образом, США предоставляли финансирование, которое в конечном итоге поддерживало исследования в WIV, но эти действия сопровождались недостаточным надзором и привели к значительным спорам и расследованиям.

Тут отчет целиком на сайте белого дома – завтра будет еще много разборов:
https://oversight.house.gov/wp-content/uploads/2024/12/12.04.2024-SSCP-FINAL-REPORT.pdf


Какой ты сегодня?
So‘rovnoma
  •   Normie
  •   Motivated
  •   Political outsider
  •   Philosophically minded
  •   Radical
  •   Freak
  •   Post factual
  •   Pinnacle of enlightenment
47 ta ovoz


Какой ты сегодня?

#memes


Научно-Технический·LAB-66·Лабораторный журнал беларуского химика dan repost
Cудя по опросу, все с этими кухонными разделочными досками предельно ясно. Ну что ж, на это у нас есть свой votum separatum. Читаем на Хабре про гигроскопичность древесины, бактерии которые живут в трещинах, склеенные из кусков бамбуковые доски и корейскую дезинфекцию с помощью утюга/микроволновки 👇

Деревянная разделочная доска. Inside

***
🔺если по каким-то причинам ссылка не открывается, то идем в web3, сюда→Кухонная доска и ее биологическое оружие


Министерство душных дел dan repost
Video oldindan ko‘rish uchun mavjud emas
Telegram'da ko‘rish
Ещë немного на тему шуток природы. Особенно переживательно за киви 👀




Блуждающий нерв dan repost
Макс Ходак загорелся идеей “живых электродов”, и уже представил первый результат: нейроны, выращиваемые в микро-лунках, положили на кору мозга мыши, они проросли вниз и связались с нервной тканью грызуна. И эти связи функциональны — мыши обучались на сигналах от привитых клеток (а те активировались светом). Поскольку BioRxiv глючит, выкладываю препринт в комментарии. Вкратце описание их подхода см. здесь.

Про концепцию “живых электродов” я писал давно, еще до этого канала (затем и в канале). Реализации бывают разные, но общее в том, что вы используете максимально природную технологию — умение клеток направлять отростки и создавать связи — и не ломаете голову над разработкой электродов, которые бы не травмировали мозг. У этой идеи, как и у любой, есть изъяны, но их кроет “уникальное предложение”: вы сможете запустить в мозг свыше миллиона живых аксонов, столько же включает зрительный нерв, и это огромный поток данных (а Ходак еще и делает зрительный протез). Вероятно, можно дойти и до десятка миллионов. — Такой BCI не под силу электронике, ни сегодня, ни завтра.

Не менее безумна идея команды из USC-UC Irvine. Они хотят через компьютер подключить к мозгу пациентов… органоиды мозга. Замысел в том, чтобы обучить 3D культуру клеток правильно интерпретировать активность мозга конкретного пациента. Такой органоид будет расти in vitro и развиваться в ответ на сигналы от ЦНС человека, когда тот будет проходить тесты, например, двигать руками по заданию. По мысли авторов, “обученный” органоид лучше приживется в мозге и легче встроится в функциональные цепи. То есть это замах на заместительную клеточную терапию.

В гранте NSF см. краткое описание проекта. Идея явно не ближайшего будущего, а по мне весьма сомнительная, но команда очень опытная как в области BCI, так и в нейрохирургии (включая того самого Чарльза Лю). — Еще безумнее: эти бы органоиды подключить к мозгу через “живые электроды”, получится второй мозг человека, как внешний диск. Не удивлюсь, если они уже думают об этом. 😉


Научно-Технический·LAB-66·Лабораторный журнал беларуского химика dan repost
Хабра #чай

Выкатил expanded материал про наши чайные пленки на Хабр. В принципе всё по мотивам LABораторных заметок [1, 2, 3].

Дополнения:

1) Добавился фрагмент про интерференционные радужные пленки и то, почему их надо отличать от "чайного гибридного биокомпозита". Плюс про эфирные масла из чая, которые такие пленки способны формировать
2) В рекомендациях по избавлению от пленки добавился цикорий, девясил, фитиновая кислота, пребиотик инулин и фрагмент из "алкоголической памятки"
3)По просьбе хабра-читателей добавлен опрос на предмет "А вы знали из чего состоит пленка на вашем чае?"
4)Добавил мышь из дудла Google, которая в день осеннего равноденствия пьет свой пленочный чай 😀

20 ta oxirgi post ko‘rsatilgan.