🔴معرفی علم بیوانفورماتیک
بیوانفورماتیک ترکیبی از زیست شناسی و فناوری اطلاعات است. اساساً، بیوانفورماتیک علمی است که اخیراً توسعه یافته و از فناوری اطلاعات برای درک پدیده بیولوژیکی استفاده میکند. بیوانفورماتیک به طور گستردهای شامل ابزارها و روشهای محاسباتی است که برای مدیریت، تجزیه و تحلیل و ادراه کردن دادههای حجیم بیولوژیکی استفاده میشود.
کاربرد بیوانفورماتیک چیست؟
بیوانفورماتیک، نه تنها برای تحقیقات اساسی زیست شناسی ژنومی و مولکولی ضروری شده است، بلکه تأثیر زیادی در بسیاری از زمینههای بیوتکنولوژی و علوم زیست پزشکی دارد. بیوانفورماتیک، در زمینههای ژنومیک ساختاری، ژنومیک عملکردی و ژنومیک تغذیهای نقشی حیاتی دارد. به عنوان مثال، برای شناسایی ارتباط بین توالی ژن و بیماریها، برای پیش بینی ساختارهای پروتئینی از توالی اسیدهای آمینه، کمک به طراحی داروها و واکسنهای جدید و ...... استفاده می شود.
کاربرد بیوانفورماتیک در پزشکی شامل : کشف داروها و واکسنها ، پزشکی انفرادی ، پزشکی پیشگیرانه ژن درمانی ، مقاومت آنتی بیوتیکی و بسیاری موارد دیگر است
نرم افزارهای مورد استفاده در بیوانفورماتیک
نرم افزارهای بیوانفورماتیک از ابزارهای پیرو خط فرمان کوتاه، تا برنامههای گرافیکی پیچیدهتر متفاوت هستند. این نرمافزارها شامل انواع رایگان و نیازمند پرداخت هزینه و همچنین نرم افزارهای تحت وب هستند که هر کدام کاربردهای مختلفی بر عهده دارند. که برخی از آنها عبارتند از :
1_ Bioconductor : یک پروژه نرم افزاری توسعه یافته و رایگان برای تجزیه و تحلیل و درک دادههای ژنومی تولید شده توسط تستهای آزمایشگاهی در زیست شناسی مولکولی است. Bioconductor بر اساس زبان آماری برنامه نویسی R استوار است اما حاوی سایر زبانهای برنامه نویسی دیگر نیز است.
BioPerl _2 : یک پروژه نرم افزاری فعال است که توسط بنیاد Open Bioinformatics پشتیبانی میشود. از این پایگاه برای رفع اشکالات موجود در پروژه توالییابی ژنوم انسان استفاده شد.
3_ Biopython : پروژه Biopython مجموعهای از ابزارهای غیر تجاری Python برای زیست شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک است که توسط یک انجمن بین المللی توسعه دهندگان ایجاد شده است. این ابزار شامل طبقهبندیهایی برای نشان دادن توالیهای بیولوژیکی و حاشیه نویسی توالیها است و قادر به خواندن و نوشتن در انواع قالبهای فایلها است. همچنین این ابزار امکان دستیابی بصورت برنامهای برای راهیابی به پایگاه دادههای آنلاین اطلاعات بیولوژیکی، مانند آنهایی که در NCBI وجود دارد را فراهم میکند.
# بیوانفورماتیک
🧬
@genetic_academic_lab